Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Tlr1Q9EPQ1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr1Q9EPQ1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tlr1Q9EPQ1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr1Q9EPQ1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr1Q9EPQ1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr1Q9EPQ1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr1Q9EPQ1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr1Q9EPQ1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr1Q9EPQ1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr1Q9EPQ1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr1Q9EPQ1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr1Q9EPQ1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr1Q9EPQ1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr1Q9EPQ1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr1Q9EPQ1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr1Q9EPQ1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr1Q9EPQ1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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