Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmg20aQ9DC33 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20aQ9DC33 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms