Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
4933402E13RikQ9D4D2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4933402E13RikQ9D4D2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4933402E13RikQ9D4D2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms