Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms