Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf139Q7TMV1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms