Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Mdc1Q5PSV9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Mdc1Q5PSV9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms