Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nedd4P46935 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms