Protein–RNA interactions for Protein: P25441

RPC53, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, yeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC53	P25441	COS3	YML132W	1140 nt		5.03	□□□□□ -1.6
RPC53	P25441	CCS1	YMR038C	750 nt		5.03	□□□□□ -1.6
RPC53	P25441	TPP1	YMR156C	717 nt		5.03	□□□□□ -1.6
RPC53	P25441	PDX3	YBR035C	687 nt		5.03	□□□□□ -1.6
RPC53	P25441	OAZ1	YPL052W	879 nt		5.03	□□□□□ -1.6
RPC53	P25441	YPL114W	YPL114W	420 nt		5.03	□□□□□ -1.6
RPC53	P25441	COS2	YBR302C	1140 nt		5.03	□□□□□ -1.6
RPC53	P25441	KGD1	YIL125W	3045 nt		5.03	□□□□□ -1.6
RPC53	P25441	HER2	YMR293C	1395 nt		5.03	□□□□□ -1.6
RPC53	P25441	OCT1	YKL134C	2319 nt		5.02	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	MDL1	YLR188W	2088 nt		5.02	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	NCE103	YNL036W	666 nt		5.02	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	UMP1	YBR173C	447 nt		5.02	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	TDA6	YPR157W	1404 nt		5.02	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	CPS1	YJL172W	1731 nt		5.02	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	LAP3	YNL239W	1365 nt		5.02	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	RGP1	YDR137W	1992 nt		5.02	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	SKM1	YOL113W	1968 nt		5.02	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	PDR15	YDR406W	4590 nt		5.01	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	GPR1	YDL035C	2886 nt		5.01	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	SPR6	YER115C	576 nt		5.01	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	DCD1	YHR144C	939 nt		5.01	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	YKR075C	YKR075C	924 nt		5.01	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	MRP21	YBL090W	534 nt		5.01	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	RAD28	YDR030C	1521 nt		5.01	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	FRE1	YLR214W	2061 nt		5.01	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	EUG1	YDR518W	1554 nt		5	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	CAF4	YKR036C	1932 nt		5	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	NFI1	YOR156C	2181 nt		5	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	YGR066C	YGR066C	879 nt		5	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	YLR402W	YLR402W	192 nt		5	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	PPA2	YMR267W	933 nt		5	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	YGP1	YNL160W	1065 nt		5	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	MRM1	YOR201C	1239 nt		5	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	DSE3	YOR264W	1293 nt		5	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	TDA11	YHR159W	1515 nt		5	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	NOP58	YOR310C	1536 nt		5	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	PMT4	YJR143C	2289 nt		5	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	STB2	YMR053C	2553 nt		5	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	NMA1	YLR328W	1206 nt		4.99	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	YNL134C	YNL134C	1131 nt		4.99	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	CBF5	YLR175W	1452 nt		4.99	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	SIR1	YKR101W	1965 nt		4.98	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	HNT2	YDR305C	654 nt		4.98	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	RMR1	YGL250W	726 nt		4.98	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	YJR012C	YJR012C	624 nt		4.98	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	RPS31	YLR167W	459 nt		4.98	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	RGS2	YOR107W	930 nt		4.98	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	NAT5	YOR253W	531 nt		4.98	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	ANT1	YPR128C	987 nt		4.98	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	STP4	YDL048C	1473 nt		4.98	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	TDA7	YNL176C	1911 nt		4.97	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	RTC1	YOL138C	4026 nt		4.97	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	SAP4	YGL229C	2457 nt		4.97	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	YMR111C	YMR111C	1389 nt		4.97	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	CPR4	YCR069W	957 nt		4.97	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	YEL045C	YEL045C	426 nt		4.97	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	YER147C-A	YER147C-A	411 nt		4.97	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	TIM21	YGR033C	720 nt		4.97	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	URE2	YNL229C	1065 nt		4.97	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	PHO12	YHR215W	1404 nt		4.97	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	PHO11	YAR071W	1404 nt		4.97	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	AKL1	YBR059C	3327 nt		4.97	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	RAD16	YBR114W	2373 nt		4.97	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	YGR125W	YGR125W	3111 nt		4.97	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	VID22	YLR373C	2706 nt		4.96	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	GGA1	YDR358W	1674 nt		4.96	□□□□□ -1.61
RPC53	P25441	IKS1	YJL057C	2004 nt		4.96	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	COQ4	YDR204W	1008 nt		4.96	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	CAF16	YFL028C	870 nt		4.96	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	ERV14	YGL054C	417 nt		4.96	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	CIA2	YHR122W	696 nt		4.96	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YHR212W-A	YHR212W-A	204 nt		4.96	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	PSR1	YLL010C	1284 nt		4.96	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YAR061W	YAR061W	204 nt		4.96	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	CIN5	YOR028C	888 nt		4.96	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	NNK1	YKL171W	2787 nt		4.96	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	POL12	YBL035C	2118 nt		4.96	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	TYW1	YPL207W	2433 nt		4.95	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	CLF1	YLR117C	2064 nt		4.95	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	PGM2	YMR105C	1710 nt		4.95	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YEH2	YLR020C	1617 nt		4.95	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	RTN1	YDR233C	888 nt		4.95	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	SNA2	YDR525W-A	240 nt		4.95	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	BUR6	YER159C	429 nt		4.95	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	ARC1	YGL105W	1131 nt		4.95	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YIL163C	YIL163C	354 nt		4.95	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	DBR1	YKL149C	1218 nt		4.95	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	ALG6	YOR002W	1635 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YDL012C	YDL012C	324 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	ARG82	YDR173C	1068 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YDR545C-A	YDR545C-A	480 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	RIP1	YEL024W	648 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YEL077W-A	YEL077W-A	483 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YER190C-B	YER190C-B	483 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YFL068W	YFL068W	483 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YGR296C-B	YGR296C-B	483 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YHL050W-A	YHL050W-A	483 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YHR219C-A	YHR219C-A	483 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YIL177W-A	YIL177W-A	483 nt		4.94	□□□□□ -1.62

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