Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
1700019A02RikA0A087WPV9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms