Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsc22d3Q9Z2S7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tsc22d3Q9Z2S7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsc22d3Q9Z2S7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsc22d3Q9Z2S7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsc22d3Q9Z2S7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsc22d3Q9Z2S7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsc22d3Q9Z2S7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsc22d3Q9Z2S7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsc22d3Q9Z2S7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsc22d3Q9Z2S7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsc22d3Q9Z2S7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsc22d3Q9Z2S7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsc22d3Q9Z2S7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsc22d3Q9Z2S7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsc22d3Q9Z2S7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsc22d3Q9Z2S7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsc22d3Q9Z2S7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms