Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Taf1dQ9D4V4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf1dQ9D4V4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Taf1dQ9D4V4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf1dQ9D4V4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf1dQ9D4V4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf1dQ9D4V4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf1dQ9D4V4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf1dQ9D4V4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf1dQ9D4V4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf1dQ9D4V4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf1dQ9D4V4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf1dQ9D4V4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf1dQ9D4V4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms