Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TirapQ99JY1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TirapQ99JY1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TirapQ99JY1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TirapQ99JY1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TirapQ99JY1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TirapQ99JY1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TirapQ99JY1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TirapQ99JY1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms