Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY1

Fchsd1, F-BAR and double SH3 domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd1Q6PFY1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fchsd1Q6PFY1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fchsd1Q6PFY1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fchsd1Q6PFY1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fchsd1Q6PFY1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fchsd1Q6PFY1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms