Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TchpQ3TVW5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms