Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capza1P47753 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capza1P47753 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capza1P47753 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capza1P47753 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capza1P47753 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capza1P47753 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Capza1P47753 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms