Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf1P46099 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klf1P46099 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf1P46099 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klf1P46099 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klf1P46099 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf1P46099 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf1P46099 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klf1P46099 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms