Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r194J3JS27 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms