Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nol3Q9D1X0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms