Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cts3Q91ZD5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cts3Q91ZD5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms