Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX35

Eda2r, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 27, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eda2rQ8BX35 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eda2rQ8BX35 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms