Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWU9

Rps27, 40S ribosomal protein S27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27Q6ZWU9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps27Q6ZWU9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps27Q6ZWU9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps27Q6ZWU9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms