Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Otol1Q4ZJM7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms