Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lmod2Q3UHZ5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lmod2Q3UHZ5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lmod2Q3UHZ5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Lmod2Q3UHZ5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Lmod2Q3UHZ5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Lmod2Q3UHZ5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Lmod2Q3UHZ5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Lmod2Q3UHZ5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Lmod2Q3UHZ5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lmod2Q3UHZ5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.8 ms