Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Ctu2Q3U308 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Ctu2Q3U308 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms