Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpusd2Q149F1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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