Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	YHL050W-A	YHL050W-A	483 nt		4.56	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YHR214W	YHR214W	612 nt		4.56	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YHR219C-A	YHR219C-A	483 nt		4.56	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YIL165C	YIL165C	360 nt		4.56	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YIL177W-A	YIL177W-A	483 nt		4.56	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YJL225W-A	YJL225W-A	483 nt		4.56	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YLL066W-A	YLL066W-A	483 nt		4.56	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YLL067W-A	YLL067W-A	483 nt		4.56	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YAR066W	YAR066W	612 nt		4.56	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YLR466C-A	YLR466C-A	483 nt		4.56	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YLR467C-A	YLR467C-A	483 nt		4.56	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YML133W-B	YML133W-B	483 nt		4.56	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YIM1	YMR152W	1098 nt		4.56	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YNL339W-B	YNL339W-B	483 nt		4.56	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YBL113W-A	YBL113W-A	483 nt		4.56	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YOR396C-A	YOR396C-A	483 nt		4.56	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YPL283W-B	YPL283W-B	483 nt		4.56	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YPR204C-A	YPR204C-A	483 nt		4.56	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	APE1	YKL103C	1545 nt		4.56	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	DBF2	YGR092W	1719 nt		4.55	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	UPS3	YDR185C	540 nt		4.55	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	SNA2	YDR525W-A	240 nt		4.55	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	NPY1	YGL067W	1155 nt		4.55	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	COA3	YJL062W-A	258 nt		4.55	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	SCP1	YOR367W	603 nt		4.55	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	STB3	YDR169C	1542 nt		4.55	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	HXT5	YHR096C	1779 nt		4.55	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YMD8	YML038C	1329 nt		4.54	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	AZR1	YGR224W	1842 nt		4.54	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	LYP1	YNL268W	1836 nt		4.54	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	SRG1	SRG1	551 nt		4.54	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	ARG82	YDR173C	1068 nt		4.54	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	RPL12A	YEL054C	498 nt		4.54	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YER145C-A	YER145C-A	438 nt		4.54	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	tL(UAG)J	tL(UAG)J	82 nt		4.54	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	tL(UAG)L1	tL(UAG)L1	82 nt		4.54	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	tL(UAG)L2	tL(UAG)L2	82 nt		4.54	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	GPP1	YIL053W	753 nt		4.54	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	BUD17	YNR027W	954 nt		4.54	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	ARC40	YBR234C	1155 nt		4.54	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	PRP40	YKL012W	1752 nt		4.54	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YER158C	YER158C	1722 nt		4.54	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YTA6	YPL074W	2265 nt		4.53	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	ADE6	YGR061C	4077 nt		4.53	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	KRE28	YDR532C	1158 nt		4.53	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	EAF5	YEL018W	840 nt		4.53	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	RIP1	YEL024W	648 nt		4.53	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	NAT2	YGR147C	867 nt		4.53	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YAL047W-A	YAL047W-A	330 nt		4.53	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	SPN1	YPR133C	1233 nt		4.53	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	BSC5	YNR069C	1470 nt		4.53	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	MCX1	YBR227C	1563 nt		4.53	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	NOC4	YPR144C	1659 nt		4.52	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	tK(CUU)C	tK(CUU)C	73 nt		4.52	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	tK(CUU)D1	tK(CUU)D1	73 nt		4.52	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	tK(CUU)D2	tK(CUU)D2	73 nt		4.52	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	tK(CUU)E1	tK(CUU)E1	73 nt		4.52	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	tK(CUU)E2	tK(CUU)E2	73 nt		4.52	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	tK(CUU)F	tK(CUU)F	73 nt		4.52	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	tK(CUU)G1	tK(CUU)G1	73 nt		4.52	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	tK(CUU)G2	tK(CUU)G2	73 nt		4.52	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	tK(CUU)G3	tK(CUU)G3	73 nt		4.52	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	tK(CUU)I	tK(CUU)I	73 nt		4.52	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	tK(CUU)J	tK(CUU)J	73 nt		4.52	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	tK(CUU)K	tK(CUU)K	73 nt		4.52	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	tK(CUU)M	tK(CUU)M	73 nt		4.52	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	tK(CUU)P	tK(CUU)P	73 nt		4.52	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	PDR16	YNL231C	1056 nt		4.52	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	RER1	YCL001W	567 nt		4.52	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	PAH1	YMR165C	2589 nt		4.52	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	LYS2	YBR115C	4179 nt		4.51	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	PHM8	YER037W	966 nt		4.51	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	YLR157W-D	YLR157W-D	213 nt		4.51	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	ADD37	YMR184W	597 nt		4.51	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	YOR379C	YOR379C	339 nt		4.51	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	ELC1	YPL046C	300 nt		4.51	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	KAP114	YGL241W	3015 nt		4.51	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	GAS3	YMR215W	1575 nt		4.51	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	CYK3	YDL117W	2658 nt		4.51	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	TSL1	YML100W	3297 nt		4.51	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	RAD57	YDR004W	1383 nt		4.51	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	GIP1	YBR045C	1920 nt		4.5	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	MSC2	YDR205W	2175 nt		4.5	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	NMD3	YHR170W	1557 nt		4.5	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	RPS16B	YDL083C	432 nt		4.5	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	ASP1	YDR321W	1146 nt		4.5	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	YGL088W	YGL088W	366 nt		4.5	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	TVP38	YKR088C	1014 nt		4.5	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	FBP1	YLR377C	1047 nt		4.5	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	ECM33	YBR078W	1290 nt		4.5	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	GCR2	YNL199C	1605 nt		4.5	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	GWT1	YJL091C	1473 nt		4.49	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	CAB3	YKL088W	1716 nt		4.49	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	GDH2	YDL215C	3279 nt		4.49	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	YTA12	YMR089C	2478 nt		4.49	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	YFT2	YDR319C	825 nt		4.49	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	YFR035C	YFR035C	345 nt		4.49	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	ISY1	YJR050W	708 nt		4.49	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	MID2	YLR332W	1131 nt		4.49	□□□□□ -1.69
ATG12	P38316	RPL15B	YMR121C	615 nt		4.49	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.1 ms