Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc10P31257 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms