Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6bQ99N09 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a6bQ99N09 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a6bQ99N09 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6bQ99N09 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms