Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf34Q99KR6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf34Q99KR6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms