Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha12Q91Y18 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha12Q91Y18 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms