Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrn2Q6PHP6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrn2Q6PHP6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms