Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa11P50709 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa11P50709 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa11P50709 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa11P50709 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa11P50709 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa11P50709 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa11P50709 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa11P50709 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms