Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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