Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms