Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z183

Padi4, Protein-arginine deiminase type-4, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi4Q9Z183 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi4Q9Z183 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Padi4Q9Z183 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms