Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmd12Q9D8W5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmd12Q9D8W5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmd12Q9D8W5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmd12Q9D8W5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmd12Q9D8W5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmd12Q9D8W5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmd12Q9D8W5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmd12Q9D8W5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmd12Q9D8W5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmd12Q9D8W5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmd12Q9D8W5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms