Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx17Q9D0I4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms