Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms