Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms