Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Neil2Q6R2P8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms