Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.9 ms