Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 225.8 ms