Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snap29Q9ERB0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Snap29Q9ERB0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms