Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChtopQ9CY57 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.2 ms