Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbm28Q8CGC6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
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