Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ClmnQ8C5W0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClmnQ8C5W0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms