Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3F7

Klhl30, Kelch-like protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl30Q8C3F7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl30Q8C3F7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl30Q8C3F7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl30Q8C3F7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl30Q8C3F7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl30Q8C3F7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms