Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms