Protein–RNA interactions for Protein: Q80YT3

Cct8l1, Chaperonin-containing TCP1, subunit 8 (theta)-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct8l1Q80YT3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cct8l1Q80YT3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cct8l1Q80YT3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cct8l1Q80YT3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cct8l1Q80YT3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cct8l1Q80YT3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cct8l1Q80YT3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cct8l1Q80YT3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cct8l1Q80YT3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cct8l1Q80YT3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cct8l1Q80YT3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cct8l1Q80YT3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cct8l1Q80YT3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cct8l1Q80YT3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cct8l1Q80YT3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cct8l1Q80YT3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cct8l1Q80YT3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cct8l1Q80YT3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cct8l1Q80YT3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cct8l1Q80YT3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cct8l1Q80YT3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cct8l1Q80YT3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cct8l1Q80YT3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cct8l1Q80YT3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cct8l1Q80YT3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cct8l1Q80YT3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms