Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SugctQ7TNE1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SugctQ7TNE1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SugctQ7TNE1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SugctQ7TNE1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SugctQ7TNE1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SugctQ7TNE1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SugctQ7TNE1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SugctQ7TNE1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms